研究报告/Research Report

新疆硬粒小麦5个品种5S rRNA基因重复单元间序列分析  

米日古丽•马木提1 , 布热比艳木•吾布力卡斯木2 , 吾买尔江•库尔班3 , 帕夏伊木•艾麦提4 , 赵奇1
1新疆农业科学院核技术生物技术研究所, 乌鲁木齐, 830000;
2新疆大学生命科学与技术学院, 乌鲁木齐, 830046;
3新疆农业大学, 乌鲁木齐, 830052;
4新疆农业科学院库车陆地棉实验站, 乌鲁木齐, 830000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 8 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001487
收稿日期: 2015年03月24日    接受日期: 2015年05月04日    发表日期: 2015年06月15日
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推荐引用:

Mamuti M.R.G.L., Wubulikasimu B.R.B.Y.M., Kuerban W.M.R.J., Aimaiti P.X.Y.M., and Zhao Q., 2015, Sequence analysis of the 5S rRNA gene repeat units in 5 durum wheat species from Xinjiang of China, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(7): 1487-1493 (米日古丽·马木提, 布热比艳木·吾布力卡斯木, 吾买尔江·库尔班, 帕夏伊木·艾麦提, 赵奇, 2015, 新疆硬粒小麦5个品种5S rRNA基因重复单元间序列分析, 分子植物育种, 13(7): 1487-1493)          

摘要

本研究参照GenBank禾本科以及前期新疆7个小麦种5S rDNA NTS序列,通过PCR技术扩增获得新疆5个硬粒小麦品种5S rDNA NTS序列,并通过与5S rRNA序列比对,得到5S rDNA NTS序列结构和边界范围。结果显示:5个硬粒小麦品种均存在两种类型5S rDNA NTS序列且相似程度不同,长NTS序列保守性较高,短NTS片段相对较低;短NTS序列存在两处序列缺失现象,两种类型NTS序列存在不同位置和程度的变异位点和变异频率。利用MEG4.0软件,采用邻接法构建了分子进化树并计算获得了品种间遗传距离。对来自不同品种克隆单元基的序列进行比对,得知对于几个组直向是存在的。直系群体的5S rDNA序列有益于硬粒小麦进一步的系统发育分析。

关键词
新疆硬粒小麦;5S rDNA;NTS;进化关系;序列分析

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《分子植物育种》印刷版
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